More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2871 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2871  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
169 aa  343  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.658562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2874  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.02 
 
 
165 aa  304  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226706  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2598  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.02 
 
 
165 aa  303  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550477  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1766  phosphopantetheine adenylyltransferase  81.71 
 
 
165 aa  281  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1799  phosphopantetheine adenylyltransferase  77.44 
 
 
165 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195414  normal  0.107346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2588  phosphopantetheine adenylyltransferase  82.32 
 
 
165 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14268  normal  0.384811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4369  phosphopantetheine adenylyltransferase  77.3 
 
 
164 aa  265  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2150  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.47 
 
 
167 aa  228  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198888  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5029  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.87 
 
 
167 aa  223  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0456512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4569  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.87 
 
 
167 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.107284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5087  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.67 
 
 
167 aa  222  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5193  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.41 
 
 
166 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3787  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  67.08 
 
 
169 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.403122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4459  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.02 
 
 
166 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1402  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.19 
 
 
166 aa  208  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1748  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 
164 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1934  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.03 
 
 
164 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1095  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
164 aa  201  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.756098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1056  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
164 aa  201  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2445  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.38 
 
 
164 aa  198  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1264  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.49 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00933319  normal  0.787413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2180  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.45 
 
 
164 aa  193  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2344  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.32 
 
 
167 aa  190  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0738  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.37 
 
 
169 aa  185  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3551  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.64 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3050  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.78 
 
 
170 aa  173  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490282  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.64 
 
 
169 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1744  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.34 
 
 
171 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2870  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.53 
 
 
162 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1916  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.79 
 
 
165 aa  147  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1392  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.34 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2960  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.34 
 
 
162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1606  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.34 
 
 
162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0491468 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4476  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.83 
 
 
164 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.07 
 
 
162 aa  141  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0420385  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
165 aa  140  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0740  phosphopantetheine adenylyltransferase  45 
 
 
165 aa  140  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  43.56 
 
 
181 aa  140  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0853169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  41.61 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0023  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.5 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.98 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0541  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.33 
 
 
169 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00492911  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4969  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  40.37 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.25 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1434  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.77 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
159 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  40.24 
 
 
159 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
159 aa  135  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
159 aa  135  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
159 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1880  phosphopantetheine adenylyltransferase  37.97 
 
 
160 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641897  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
159 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1743  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.59 
 
 
172 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
159 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
159 aa  135  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  40.24 
 
 
159 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.1 
 
 
159 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.62 
 
 
160 aa  134  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2252  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.67 
 
 
170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0603584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.12 
 
 
159 aa  134  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4838  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.21 
 
 
161 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000302126  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.49 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.49 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.49 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0004  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.12 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0106  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  38.65 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0691876 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.49 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0163  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.49 
 
 
159 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0065  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
159 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000149443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4151  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
159 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000257789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3723  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.51 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.172497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.49 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
167 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
167 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0548  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  39.26 
 
 
164 aa  130  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  40.24 
 
 
162 aa  130  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1243  phosphopantetheine adenylyltransferase  37.42 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.27 
 
 
170 aa  130  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0188  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.88 
 
 
161 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0127125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2205  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.26 
 
 
164 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  36.97 
 
 
165 aa  130  9e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.724641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4138  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.96 
 
 
171 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2115  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.26 
 
 
164 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.49 
 
 
163 aa  130  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0609  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.27 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2734  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.715247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.49 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.49 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2084  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.39 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.88 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0641  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.27 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.36 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.85 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.12 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2935  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
167 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  42.04 
 
 
170 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>