More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1982 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1982  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
164 aa  329  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1700  phosphopantetheine adenylyltransferase  98.78 
 
 
164 aa  324  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.880065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1227  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.4 
 
 
167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.53 
 
 
159 aa  184  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1276  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.21 
 
 
159 aa  181  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000385015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.85 
 
 
160 aa  180  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1578  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.59 
 
 
165 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0742477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4033  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50 
 
 
160 aa  177  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1168  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.3 
 
 
165 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  0.219485 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1107  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.55 
 
 
166 aa  177  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.371487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1880  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.63 
 
 
160 aa  177  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2741  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.1 
 
 
168 aa  177  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1243  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.96 
 
 
164 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1349  Phosphopantetheine adenylyltransferase  50.93 
 
 
162 aa  175  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292302  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1282  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.87 
 
 
162 aa  174  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730863  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1879  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.35 
 
 
165 aa  174  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0979475  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2190  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.73 
 
 
160 aa  174  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000182101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2500  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.56 
 
 
162 aa  174  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0668  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
160 aa  174  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1759  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
163 aa  173  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282683  normal  0.0728276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2783  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.23 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0449277  normal  0.117453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.32 
 
 
162 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1640  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.03 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000016077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09450  Phosphopantetheine adenylyltransferase  50.63 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0611  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.33 
 
 
162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0627  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.33 
 
 
162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.842501 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0633  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.17 
 
 
163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.3 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0516  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 
159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.266942  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1113  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.92 
 
 
163 aa  171  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.24 
 
 
163 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5968  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.2 
 
 
160 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10140  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.32 
 
 
162 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.089106  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1172  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.66 
 
 
158 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170767  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1184  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
160 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0454374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  50.33 
 
 
159 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0106  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.5 
 
 
161 aa  169  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0691876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0699  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.5 
 
 
161 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000151167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1206  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
160 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  50 
 
 
160 aa  168  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1365  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
163 aa  168  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.287294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4138  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.12 
 
 
171 aa  168  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0004  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.33 
 
 
162 aa  168  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2007  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.67 
 
 
166 aa  167  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1000  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.37 
 
 
169 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000348032  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1945  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
170 aa  167  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1925  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
158 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551466  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1991  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
158 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  49.37 
 
 
166 aa  167  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0173  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.74 
 
 
253 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000768872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.4 
 
 
159 aa  167  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.5 
 
 
171 aa  166  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049418  normal  0.0168021 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0715  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.33 
 
 
161 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.429176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
164 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1769  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.39 
 
 
164 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0050342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3502  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.79 
 
 
166 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000195906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3436  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.5 
 
 
160 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.742639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.03 
 
 
159 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.81 
 
 
159 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.81 
 
 
159 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1134  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.25 
 
 
162 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471716  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.81 
 
 
159 aa  165  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.81 
 
 
159 aa  165  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.81 
 
 
159 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  45.81 
 
 
159 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.81 
 
 
159 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.81 
 
 
159 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.81 
 
 
159 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1599  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.74 
 
 
186 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.1 
 
 
159 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.08 
 
 
164 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2167  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.17 
 
 
160 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.73 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.71709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4196  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.2 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6137  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.53 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109378  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05610  Phosphopantetheine adenylyltransferase  48.73 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  normal  0.709032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
183 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.96 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7998  Pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.53 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248261  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2084  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.51 
 
 
161 aa  164  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3308  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.41 
 
 
169 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
159 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2818  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.53 
 
 
165 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795983  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2318  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.08 
 
 
161 aa  164  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0209  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.51 
 
 
164 aa  164  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.53 
 
 
165 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.86 
 
 
163 aa  164  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2807  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.53 
 
 
165 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.05 
 
 
161 aa  164  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143727  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.45 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.45 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.45 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.45 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1803  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.88 
 
 
171 aa  163  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.45 
 
 
159 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0188  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.05 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0127125  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3224  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.81 
 
 
166 aa  163  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1142  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.37 
 
 
160 aa  163  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1994  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.01 
 
 
157 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>