More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4368 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4368  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  100 
 
 		 167 aa  339  9e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3869  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  86.06 
 
 		 167 aa  283  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4765  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  85.28 
 
 		 167 aa  281  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  84.34 
 
 		 166 aa  279  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1803  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  79.14 
 
 		 171 aa  262  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3502  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  65.22 
 
 		 166 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000195906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.9 
 
 		 165 aa  225  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.9 
 
 		 165 aa  225  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3224  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.1 
 
 		 166 aa  220  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.03 
 
 		 167 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.03 
 
 		 167 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.46 
 
 		 161 aa  207  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.69 
 
 		 168 aa  207  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0285  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 		 161 aa  207  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6137  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.87 
 
 		 165 aa  204  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.87 
 
 		 165 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2818  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.87 
 
 		 165 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2807  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.87 
 
 		 165 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0310  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.62 
 
 		 168 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1924  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.03 
 
 		 165 aa  202  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3125  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.88 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0748  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.88 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.82241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.88 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0093  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.88 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0469  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.88 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2725  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.25 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.284056  normal  0.758583 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0564  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.88 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00247535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2925  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.88 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1497  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.88 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2867  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.25 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0494  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.25 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049418  normal  0.0168021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4138  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.76 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.86 
 
 		 160 aa  194  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2734  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.96 
 
 		 165 aa  190  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3723  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.74 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.172497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3620  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.33 
 
 		 162 aa  184  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.870553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.48 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0091  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  56.41 
 
 		 163 aa  180  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.77 
 
 		 161 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.77 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  55.48 
 
 		 159 aa  177  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.48 
 
 		 159 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.77 
 
 		 183 aa  177  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.77 
 
 		 159 aa  177  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.77 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0895  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  55.06 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.13 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  54.43 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  56.25 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.13 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.46 
 
 		 160 aa  175  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.564198 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1282  coenzyme A biosynthesis protein  59.59 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.85 
 
 		 163 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.85 
 
 		 163 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  53.5 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.83 
 
 		 163 aa  174  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.48 
 
 		 159 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.77 
 
 		 170 aa  173  9e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  55 
 
 		 164 aa  173  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0548  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  55.13 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.21 
 
 		 163 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0053  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.92 
 
 		 160 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2006  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  55.56 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0110  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  52.56 
 
 		 189 aa  169  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.800905  normal  0.0383495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.6 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.95 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4684  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.42 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.63 
 
 		 160 aa  167  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.85 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.27 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.28 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4276  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.74 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4331  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.74 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00059  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.64 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.3 
 
 		 158 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0068  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.06 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.61 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4471  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.74 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2603  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.29 
 
 		 164 aa  163  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000855296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4151  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000257789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.87 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0065  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000149443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.37 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0298  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  55.06 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1186  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.36 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 		 168 aa  160  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.77 
 
 		 162 aa  160  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0420385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  51.9 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0853169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.68 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1371  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.03 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1550  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.09 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0805117  normal  0.396809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>