52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0143 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0143  Ham1-like protein  100 
 
 		 215 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0267  HAM1 protein  37.78 
 
 		 181 aa  99  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2385  Ham1-like protein  32.12 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.23307  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2226  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  28.22 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1216  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  28.4 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.96575 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1460  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  30.72 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0739  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  30.46 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.193658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2602  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  28.21 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.031675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1229  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  27.78 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1406  non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1 family  29.25 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1568  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  29.6 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000111249 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0652  hypothetical protein  28.83 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.790003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1506  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  32.67 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.361165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1194  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  27.03 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0192  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  27.33 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0656  non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1 family  25.87 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72696  inosine triphosphate pyrophosphatase, putative / HAM1 family protein  32.26 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.497197  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1580  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  28.22 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12168  predicted protein  33.33 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1530  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  26.9 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000178191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0278  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  26.35 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.885996 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1696  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  29.09 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000106449 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1277  non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1 family  31.25 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0175  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  25.45 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0169  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  25.45 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08861  nucleoside triphosphatase (Eurofung)  26.63 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.918631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03000  DNA repair-related protein, putative  29.86 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.947701  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44176  predicted protein  27.74 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2326  Ham1-like protein  30.1 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1510  non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1 family  28.92 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0615  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  27.73 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000062895 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1176  Ham1 family protein  29.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.865666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0184  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  23.08 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0837  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  24.5 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0000474937  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0916  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  27.87 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1974  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  29.85 
 
 		 183 aa  45.4  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4014  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  24.24 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260345  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0004  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  25.15 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0172  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  36.62 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_002950  PG1603  putative deoxyribonucleoside-triphosphatase  26.27 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.667769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0150  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  23.93 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0395  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  22.36 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0779  Ham1 family protein  35.14 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0868324  normal  0.187444 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2200  Ham1 family protein  27.37 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2209  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  35.29 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1336  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  32.5 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3653  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  37.88 
 
 		 203 aa  42  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266046  normal  0.466035 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0843  non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1 family  26.09 
 
 		 211 aa  42  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6026  non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1 family  34.31 
 
 		 192 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0617339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3424  Ham1 family protein  29.58 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.917261 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1665  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  35.21 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0174  non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1 family  30.12 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.139791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>