153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3061 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3061  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
215 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3736  glutathione S-transferase-like protein  53.37 
 
 
207 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4710  glutathione S-transferase family protein  32.06 
 
 
225 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.352586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1853  Glutathione S-transferase domain protein  29.35 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2061  transferase homolog  35.16 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.40071  normal  0.023691 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2205  putative transferase  26.92 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311341  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1541  transferase-like protein  35.16 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1727  putative transferase  34.38 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.214666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2192  putative transferase  34.38 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01411  predicted enzyme  33.59 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0982853  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2409  glutathione S-transferase-like protein  28.71 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216575  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01422  hypothetical protein  33.59 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1717  hypothetical protein  32.81 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0059  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.07 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2673  putative glutathione S-transferase  25.57 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  28.85 
 
 
215 aa  61.6  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  31.19 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  31.48 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.12 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0764  glutathione S-transferase-like protein  25.14 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4988  glutathione S-transferase-like protein  26.4 
 
 
215 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0332  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.46 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  27.51 
 
 
214 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  32.87 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  32.17 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  23.65 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  41.86 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  30.34 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  31.67 
 
 
216 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0721  glutathione S-transferase  28 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.195478  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  35.34 
 
 
201 aa  51.6  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2272  Glutathione S-transferase-like protein  35.8 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  30.47 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  29.17 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.82 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1474  glutathione S-transferase, putative  33.62 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1190  Glutathione S-transferase domain  33.62 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  37.38 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  26.98 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  33.05 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.65 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  23.15 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  23.15 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  23.15 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1498  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.87 
 
 
233 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.32 
 
 
203 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  34.17 
 
 
214 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  30.09 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  37.89 
 
 
210 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2782  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
142 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.724853  normal  0.967961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.29 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 
214 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 
214 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0453  hypothetical protein  37.66 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0978752  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.33 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1267  hypothetical protein  34.02 
 
 
203 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 
214 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.05 
 
 
214 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  34.38 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  37.08 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2945  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.44 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  33.68 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  29.2 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  35.48 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  35.48 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  35.48 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  27.42 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.76 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.29 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  35.48 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  29.13 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1395  glutathione S-transferase like protein  36.59 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00727348  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  35.48 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  35.48 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.16 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4683  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.3 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6162  Glutathione S-transferase domain  27.72 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6524  maleylacetoacetate isomerase  45.21 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2997  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0895357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45470  hypothetical protein  39.47 
 
 
228 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2860  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  33.65 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0279  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.46 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  hitchhiker  0.00117487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  29.69 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2337  glutathione S-transferase-like  34.52 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0459494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  35.79 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2951  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.52 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  27.69 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2946  glutathione S-transferase-like  26.26 
 
 
207 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.0000427807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2404  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
214 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0926545  normal  0.705614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14290  hypothetical protein  32.99 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.128982  normal  0.822767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  32.08 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  35.56 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.483712 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>