More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1190 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1474  glutathione S-transferase, putative  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1190  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1303  glutathione S-transferase  73.04 
 
 
204 aa  315  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48720  Glutathione S-transferase  68.97 
 
 
209 aa  284  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1115  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.67 
 
 
214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0129  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.18 
 
 
219 aa  274  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2404  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.15 
 
 
214 aa  261  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0926545  normal  0.705614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2166  putative glutathione S-transferase  62.07 
 
 
213 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4683  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.4 
 
 
214 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1076  glutathione S-transferase  59.81 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.079186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1740  Glutathione S-transferase domain protein  54.41 
 
 
204 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.26 
 
 
206 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2946  glutathione S-transferase-like  39.39 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.0000427807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.54 
 
 
215 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  35.89 
 
 
215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2860  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.3 
 
 
212 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2945  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.3 
 
 
212 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  35.75 
 
 
204 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2997  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.3 
 
 
212 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0895357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  37.2 
 
 
201 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  34.3 
 
 
204 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  33.01 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2972  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2337  glutathione S-transferase-like  36.22 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0459494  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2951  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.22 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  33.49 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  33.49 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  33.49 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  35.27 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  32.51 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  33.18 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  33.33 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  31.43 
 
 
201 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6303  glutathione S-transferase-like protein  36.11 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  32.85 
 
 
204 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  34.13 
 
 
204 aa  92  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  34.13 
 
 
204 aa  92  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  32.54 
 
 
214 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  31.9 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  36.32 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  33.01 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  33.49 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.86 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  31.88 
 
 
203 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  33.01 
 
 
202 aa  89  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  34.6 
 
 
196 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.04 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0332  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.98 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 
206 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 
216 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  32.54 
 
 
201 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0613  putative glutathione S-transferase  33.18 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.59 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  32.21 
 
 
201 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  32.85 
 
 
204 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  34.45 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.51 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  28.64 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  30.39 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.62 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  31.73 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  31.88 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  30.92 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  31.02 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  31.1 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0872  glutathione S-transferase-like  32.67 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  32.67 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  32.57 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.57 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.57 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3328  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.934349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  30.62 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.3 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  31.88 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.23 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  33.49 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  33.49 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  33.49 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  27.8 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  33.49 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  33.49 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  33.49 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  33.49 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  33.49 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0721  glutathione S-transferase  31.11 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.195478  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3504  Glutathione S-transferase domain  29.67 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  31.9 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.86 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  33.33 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  32.86 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  31.07 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  33.33 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>