More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0059 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0059  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2409  glutathione S-transferase-like protein  43.2 
 
 
213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216575  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1541  transferase-like protein  35.61 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2061  transferase homolog  35.12 
 
 
205 aa  124  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.40071  normal  0.023691 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2192  putative transferase  36.1 
 
 
205 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130719  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1717  hypothetical protein  35.12 
 
 
205 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01411  predicted enzyme  35.61 
 
 
205 aa  121  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0982853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01422  hypothetical protein  35.61 
 
 
205 aa  121  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2205  putative transferase  34.8 
 
 
199 aa  121  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311341  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1853  Glutathione S-transferase domain protein  34.62 
 
 
227 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4710  glutathione S-transferase family protein  34.39 
 
 
225 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.352586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1727  putative transferase  35.22 
 
 
165 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.214666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3736  glutathione S-transferase-like protein  34.05 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  32.57 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  31.71 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  36.36 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  35.38 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  34.68 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.1 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  29.5 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  35.4 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  29.5 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  32.76 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  32.45 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  32.45 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3905  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.86 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  31.78 
 
 
206 aa  72  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  30.98 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  30.64 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.75 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  32.32 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  29.38 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  29.82 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0838  Glutathione S-transferase domain  27.75 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0958  Glutathione S-transferase domain protein  28.9 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  28.16 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  27.33 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  29.28 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  30.81 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  27.33 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.45 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  27.33 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  28.18 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  29.65 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3061  putative glutathione S-transferase  31.07 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  31.98 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.32 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  29.28 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  29.28 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  30.41 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  28.9 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  28.32 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.57 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  27.87 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  27.49 
 
 
202 aa  61.6  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  28.16 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  25.99 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  31.43 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  33.57 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  33.57 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.51 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  27.33 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  24.88 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.07 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  28 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0721  glutathione S-transferase  26.71 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.195478  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.74 
 
 
200 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  30.87 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  26.32 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.78 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.32 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  27.39 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  25.38 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  26.25 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  29.55 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3328  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.08 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.934349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0613  putative glutathione S-transferase  28.05 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  27.43 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.75 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  26.29 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0764  glutathione S-transferase-like protein  27.63 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.75 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.75 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.17 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  32.95 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  32.82 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  31.11 
 
 
299 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  29.37 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  28.39 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2673  putative glutathione S-transferase  25.44 
 
 
203 aa  55.1  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.75 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0556  glutathione S-transferase  31.93 
 
 
169 aa  54.7  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
234 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  25.84 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>