211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0556 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0556  glutathione S-transferase  100 
 
 		 169 aa  347  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.31 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  35.48 
 
 		 201 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  38.31 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  38.31 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 		 203 aa  104  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  39.31 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  39.04 
 
 		 202 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.95 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  38.56 
 
 		 203 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  37.91 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  35.29 
 
 		 201 aa  100  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  34.84 
 
 		 204 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.66 
 
 		 202 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  35.29 
 
 		 201 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  36.6 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  35.67 
 
 		 204 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  35.95 
 
 		 204 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  37.01 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  37.91 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.56 
 
 		 216 aa  95.5  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  37.66 
 
 		 206 aa  94.4  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  33.12 
 
 		 201 aa  94.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  38.85 
 
 		 203 aa  93.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4046  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.26 
 
 		 207 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.862482  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  35.53 
 
 		 202 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  34.64 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  33.99 
 
 		 202 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  35.06 
 
 		 204 aa  91.3  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.75 
 
 		 210 aa  91.3  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.75 
 
 		 210 aa  91.3  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  37.75 
 
 		 218 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  35.21 
 
 		 201 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  32.93 
 
 		 212 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  33.77 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  35.21 
 
 		 201 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  35.21 
 
 		 201 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  34.39 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3328  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.46 
 
 		 211 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.934349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0958  Glutathione S-transferase domain protein  38.3 
 
 		 227 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.52 
 
 		 211 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.64 
 
 		 202 aa  88.2  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 		 206 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  31.61 
 
 		 201 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.52 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  31.37 
 
 		 201 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.39 
 
 		 202 aa  84.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.05 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.33 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  34.16 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0838  Glutathione S-transferase domain  35.46 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4263  glutathione S-transferase-like protein  34.19 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  34.81 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3179  Glutathione S-transferase domain protein  30.52 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6902  putative glutathione S-transferase  34 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.232185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  32.05 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  29.33 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2442  glutathione S-transferase-like protein  33.11 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666537  normal  0.209584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  30.07 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  30.07 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  30.07 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  30.07 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  30.07 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3504  Glutathione S-transferase domain  29.87 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  30.07 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  30.07 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  30.07 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  28.67 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  28.67 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  28.67 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  28.67 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  28.67 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  32.82 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.85 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  35.06 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  30.2 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  33.77 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0332  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.89 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  29.41 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  25 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  34.67 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2900  putative glutathionine S-transferase  32.06 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2419  putative glutathione S-transferase  29.53 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2779  putative glutathione S-transferase  29.53 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722069  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  30.99 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  27.7 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0597  glutathione S-transferase, putative  29.53 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2840  glutathione S-transferase  29.53 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.33 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2872  putative glutathione S-transferase  29.53 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1730  putative glutathione S-transferase  29.53 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  30.57 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1853  Glutathione S-transferase domain protein  28.23 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0059  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.93 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  29.33 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>