More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0764 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0764  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
198 aa  410  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2673  putative glutathione S-transferase  62.63 
 
 
203 aa  266  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3905  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.53 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  31.4 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  30.92 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0613  putative glutathione S-transferase  28.65 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  30.29 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.61 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  29.71 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  28.1 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  29.61 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  28.1 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  29.61 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  29.61 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  28.64 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.24 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  26.47 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  28.29 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.07 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  28.49 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  28.99 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  28.29 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  26.87 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  30.34 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  29.27 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  28.74 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.77 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.81 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  29.31 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.34 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.18 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0958  Glutathione S-transferase domain protein  29.38 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  27.94 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  27.65 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.8 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  26.96 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  28.71 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0484  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.09 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  23.67 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  27.05 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  28.29 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  26.83 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0838  Glutathione S-transferase domain  28.44 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  27.32 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  30.11 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  26.34 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  30 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.5 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0872  glutathione S-transferase-like  28.81 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.38 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  29.8 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  25.85 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  27 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  27.59 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  26.19 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  26.19 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  23.41 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.62 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.19 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  25.49 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.85 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  28.28 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  25.75 
 
 
299 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  25 
 
 
201 aa  61.6  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3352  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.47 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148422  hitchhiker  0.0000403309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 
214 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3504  Glutathione S-transferase domain  24.64 
 
 
209 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  27.92 
 
 
204 aa  61.2  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  25.49 
 
 
202 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  27.78 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  27.33 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  29.76 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4895  Glutathione S-transferase domain  30.53 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.123273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3179  Glutathione S-transferase domain protein  25.12 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  25.49 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4988  glutathione S-transferase-like protein  26.86 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  22.71 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  28.29 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  23.9 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  23.44 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1303  glutathione S-transferase  25.99 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2946  glutathione S-transferase-like  27.91 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.0000427807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  28.57 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  29.25 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  27.88 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  23.9 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.51 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  23.9 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  23.9 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.44 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  23.9 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  27.88 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.77 
 
 
207 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  28.89 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  25.87 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.92 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2166  putative glutathione S-transferase  24.24 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  28.37 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>