133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2192 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2192  putative transferase  100 
 
 
205 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01411  predicted enzyme  98.54 
 
 
205 aa  421  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0982853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01422  hypothetical protein  98.54 
 
 
205 aa  421  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1541  transferase-like protein  98.05 
 
 
205 aa  417  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2061  transferase homolog  97.07 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.40071  normal  0.023691 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2205  putative transferase  95.12 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311341  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1717  hypothetical protein  92.2 
 
 
205 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1727  putative transferase  98.09 
 
 
165 aa  318  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.214666  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0059  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 
209 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2409  glutathione S-transferase-like protein  35.61 
 
 
213 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216575  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4710  glutathione S-transferase family protein  33.17 
 
 
225 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.352586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1853  Glutathione S-transferase domain protein  31.16 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3061  putative glutathione S-transferase  34.38 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  25.73 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.21 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  26.21 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  27.18 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  27.67 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3736  glutathione S-transferase-like protein  28.85 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  30.34 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  26.7 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.86 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  24.27 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  24.64 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  25.6 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  26.09 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  30.9 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  29.65 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  25.5 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.21 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.47 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  27.4 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  27.4 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  27.81 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  30.46 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  28.21 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  24.04 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.32 
 
 
211 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.02 
 
 
202 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 
203 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  26.32 
 
 
203 aa  61.6  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  26.75 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  28.29 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  26.92 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.17 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.06 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  27.12 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.12 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  24.88 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.12 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  25.74 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  24.64 
 
 
201 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  24.64 
 
 
201 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  24.64 
 
 
201 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  27.78 
 
 
206 aa  58.2  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  29.44 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0613  putative glutathione S-transferase  26.42 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  27.32 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  28.29 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  26.87 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  27.59 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  26.83 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  23.61 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.32 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  25 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  25.12 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  25 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  25 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  25 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  25 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  25 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  27.8 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  22.33 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  27.8 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  27.8 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  27.8 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  26.86 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.65 
 
 
207 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2808  glutathione S-transferase-like  25.93 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0298  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.93 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732377  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.15 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  25.71 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  28.74 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  22.33 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  28.74 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.17 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0279  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.4 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  hitchhiker  0.00117487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2442  glutathione S-transferase-like protein  25.14 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666537  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.27 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  25.88 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  24.24 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  25.44 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>