More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2097 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  209  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
107 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  53.61 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  53.61 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  53.61 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  53.61 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  51.55 
 
 
112 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  51.55 
 
 
112 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  51.55 
 
 
109 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  51.55 
 
 
109 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  51.55 
 
 
109 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  50 
 
 
108 aa  110  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  54.9 
 
 
107 aa  110  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  53.47 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  53.47 
 
 
107 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  49.02 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  49.02 
 
 
108 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  48.04 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  48.04 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  48.04 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  52.48 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  52.48 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  50.49 
 
 
107 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  50.49 
 
 
107 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  48.04 
 
 
108 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  48.04 
 
 
108 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  52.48 
 
 
109 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  47.06 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  46.08 
 
 
108 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  46.08 
 
 
108 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  50 
 
 
107 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  55.1 
 
 
110 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  55.1 
 
 
110 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  50.52 
 
 
108 aa  103  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1313  hypothetical protein  80.7 
 
 
60 aa  103  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  48.51 
 
 
107 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  47.52 
 
 
107 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  48.51 
 
 
107 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  48 
 
 
109 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  48 
 
 
109 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  48 
 
 
109 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  48.54 
 
 
108 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  48.45 
 
 
108 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  48.45 
 
 
108 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  47.57 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  47.57 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  45.54 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  52.58 
 
 
103 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  46.53 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  46.53 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  46.53 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  46.53 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0190  hypothetical protein  87.72 
 
 
59 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0877203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  47.47 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  44.55 
 
 
107 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  44.55 
 
 
107 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  42.57 
 
 
108 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  41.32 
 
 
125 aa  84.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0077  putative transposase family protein  47.56 
 
 
167 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  46.15 
 
 
492 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0288  transposase subfamily  42.39 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.07567e-42  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  45 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>