More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8266 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  221  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  90.83 
 
 
109 aa  203  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  90.83 
 
 
109 aa  203  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8280  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  179  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  80 
 
 
109 aa  174  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  80.58 
 
 
107 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  79.61 
 
 
107 aa  171  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  79.05 
 
 
109 aa  169  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  79.05 
 
 
109 aa  169  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  76.7 
 
 
107 aa  163  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  76.7 
 
 
107 aa  163  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  64.49 
 
 
110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  64.49 
 
 
110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  66.02 
 
 
107 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  66.02 
 
 
107 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  64.81 
 
 
109 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  64.81 
 
 
109 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  65.05 
 
 
107 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
108 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
108 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  64.76 
 
 
107 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  68.63 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  64.15 
 
 
108 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  62.86 
 
 
107 aa  137  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  62.86 
 
 
107 aa  137  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  64.36 
 
 
107 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  72.22 
 
 
492 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  61.11 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  61.11 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 
109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 
109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 
109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  64.08 
 
 
107 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  60.48 
 
 
125 aa  133  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  61.76 
 
 
107 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  62.86 
 
 
108 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  60.38 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  60.38 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  60.38 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  60.38 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  58.25 
 
 
108 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  62.14 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  58.18 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  57.27 
 
 
108 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  57.8 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  54.55 
 
 
108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  56.36 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  56.36 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  56.36 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  56 
 
 
107 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  56 
 
 
107 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  56 
 
 
107 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  56 
 
 
107 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  55.45 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  54.55 
 
 
108 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  54.37 
 
 
107 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  54.55 
 
 
108 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  54.55 
 
 
108 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  48 
 
 
102 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  53.64 
 
 
108 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  49.49 
 
 
105 aa  96.7  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  49.49 
 
 
105 aa  96.7  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  45.45 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  45.45 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  45.45 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  45.45 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  45.45 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  45.45 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  45.45 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  45.45 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>