More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4952 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  219  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  87.96 
 
 		 108 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  87.96 
 
 		 108 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  87.96 
 
 		 108 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  87.96 
 
 		 108 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  76.42 
 
 		 107 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  76.42 
 
 		 107 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  78.9 
 
 		 109 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  78.9 
 
 		 109 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  76.85 
 
 		 107 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  75.24 
 
 		 107 aa  166  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  75.24 
 
 		 107 aa  164  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  71.43 
 
 		 107 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 107 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  70.37 
 
 		 107 aa  160  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  72.82 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  72.82 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  72.82 
 
 		 109 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  72.82 
 
 		 109 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  72.82 
 
 		 109 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  65.09 
 
 		 109 aa  141  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  65.09 
 
 		 109 aa  141  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  64.15 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  63.55 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  62.62 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  63.21 
 
 		 109 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  63.81 
 
 		 107 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  62.04 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  62.04 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  58.49 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  58.49 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  60 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  60 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  60 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  57.01 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  57.01 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  59.81 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  59.81 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  59.81 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  59.81 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  58.1 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  54.63 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  60 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  58.49 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  59.05 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  57.69 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  52.88 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  58.1 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  58.1 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  58.1 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  58.1 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  56.19 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8280  hypothetical protein  61.63 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  57.14 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  60 
 
 		 492 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  55.14 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  56.19 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  56.19 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  55.24 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  53.21 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  48.54 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2447  transposase IS3/IS911 family protein  53.4 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000211632  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  52.43 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  52.43 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  48.62 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  54 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  54 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  54 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  54 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  54 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>