142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0190 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0190  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  116  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0877203 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  87.72 
 
 
102 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1316  hypothetical protein  70.21 
 
 
61 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  78.38 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  67.57 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  67.57 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  75.76 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  75.76 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  68.57 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  68.57 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  69.7 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  69.7 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  61.36 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  61.36 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  61.36 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  69.7 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  61.36 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  50.98 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  50.98 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  69.7 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  54.9 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  64.71 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  50 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  54.05 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  48.28 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  54.05 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  70.97 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  69.7 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  51.35 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  51.35 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  51.35 
 
 
108 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  71.88 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  51.35 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  51.35 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  62.86 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  62.86 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  56.41 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  56.41 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  56.41 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  56.41 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  62.86 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4702  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.677294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3431  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3613  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4733  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2810  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.978758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2616  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2168  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226966  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4664  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>