214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0288 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0288  transposase subfamily  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.07567e-42  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0077  putative transposase family protein  96.43 
 
 		 167 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  93.1 
 
 		 108 aa  169  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  93.1 
 
 		 108 aa  169  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  93.1 
 
 		 108 aa  169  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  87.36 
 
 		 108 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  89.77 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  90.91 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  90.8 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  95.4 
 
 		 108 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  95.4 
 
 		 108 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  95.4 
 
 		 108 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  95.4 
 
 		 108 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  95.4 
 
 		 108 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  95.4 
 
 		 108 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  87.5 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  94.25 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  93.1 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  94.25 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  94.25 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  94.25 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  94.25 
 
 		 108 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  93.1 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  93.1 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  93.1 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  93.1 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  93.1 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  93.1 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  94.25 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  94.25 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  94.25 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  59.55 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  59.55 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  59.55 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  59.55 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  59.55 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  59.77 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  59.77 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  60.92 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  60.92 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  57.45 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  57.47 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  56.98 
 
 		 109 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  56.98 
 
 		 109 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  61.63 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  55.29 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  57.95 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8280  hypothetical protein  53.33 
 
 		 100 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  55.29 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  55.29 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  55.29 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  55.29 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  53.49 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  53.49 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  52.81 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  51.69 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  51.69 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  55.81 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  55.81 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  55.81 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  55.81 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  53.93 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2093  transposase  55 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732705 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  43.48 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  45.98 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1861  hypothetical protein  58.73 
 
 		 239 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  46.75 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0310  hypothetical protein  91.43 
 
 		 55 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  46.67 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  46.67 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  46.67 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  46.67 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  46.67 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>