More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4402 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6126  putative rubredoxin reductase  82.89 
 
 
384 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
382 aa  761    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.940486  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70620  putative rubredoxin reductase  83.16 
 
 
384 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5314  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  78.8 
 
 
382 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0540022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  80.63 
 
 
382 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312913  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5028  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  80.37 
 
 
382 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  78.01 
 
 
382 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5362  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.75 
 
 
382 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.303457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5473  rubredoxin reductase  80.1 
 
 
382 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0159  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  76.7 
 
 
382 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3591  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.84 
 
 
385 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0681  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.98 
 
 
381 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1378  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.63 
 
 
389 aa  363  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.529834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0171  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.82 
 
 
384 aa  354  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16415  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1816  rubredoxin-NAD(+) reductase  43.24 
 
 
383 aa  333  2e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0379  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.5 
 
 
383 aa  332  5e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3250  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.13 
 
 
386 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2315  putative rubredoxin reductase  46.56 
 
 
378 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3270  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.19 
 
 
382 aa  299  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.415771  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0789  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.84 
 
 
396 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  44.69 
 
 
461 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3669  putative rubredoxin reductase  44.44 
 
 
383 aa  285  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3466  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.9 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4857  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.82 
 
 
402 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.485222  normal  0.0812896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4052  nitric oxide reductase  38.58 
 
 
381 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0092  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.6 
 
 
434 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  38.52 
 
 
477 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001302  nitric oxide reductase FlRd-NAD(+) reductase  35.54 
 
 
382 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1582  nitric oxide reductase  34.47 
 
 
381 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.63 
 
 
480 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3651  nitric oxide reductase  34.65 
 
 
389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0783  nitric oxide reductase  36.19 
 
 
382 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2200  nitric oxide reductase  32.89 
 
 
381 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3034  nitric oxide reductase  36.32 
 
 
379 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2834  nitric oxide reductase  36.77 
 
 
377 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0243221 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0978  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.51 
 
 
377 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186108  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1001  nitric oxide reductase  36.51 
 
 
377 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0544101  hitchhiker  0.00016497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2995  nitric oxide reductase  36.51 
 
 
377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3961  nitric oxide reductase  36.51 
 
 
377 aa  216  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2847  nitric oxide reductase  36.24 
 
 
377 aa  215  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02561  nitric oxide reductase  35.98 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02526  hypothetical protein  35.98 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1020  nitric oxide reductase  33.24 
 
 
382 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.423073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3166  nitric oxide reductase  35.98 
 
 
377 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3183  nitric oxide reductase  34.66 
 
 
377 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3027  nitric oxide reductase  35.28 
 
 
377 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.2 
 
 
476 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2961  nitric oxide reductase  35.01 
 
 
377 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3043  nitric oxide reductase  35.01 
 
 
377 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0659662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.73 
 
 
469 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3150  nitric oxide reductase  35.01 
 
 
377 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0327355 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.71 
 
 
455 aa  202  9e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2992  nitric oxide reductase  34.75 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577076 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3261  nitric oxide reductase  33.59 
 
 
398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.12 
 
 
415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0307  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.59 
 
 
419 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1755  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.87 
 
 
410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430689  normal  0.0145499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0338  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.14 
 
 
411 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.38 
 
 
444 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2061  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.53 
 
 
462 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.13 
 
 
444 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  31.4 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0173  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.78 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.41 
 
 
444 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2816  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.06 
 
 
413 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.477075  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2274  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.6 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.09 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.64 
 
 
478 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1118  assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  32.92 
 
 
414 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0668  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  29.53 
 
 
826 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2152  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  28.8 
 
 
801 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.57135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1997  nitrite reductase  28.25 
 
 
801 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00110354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1949  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  28.48 
 
 
801 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0412209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2146  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  28.25 
 
 
801 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2906  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  28.17 
 
 
1381 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2177  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  28.25 
 
 
801 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1156  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.49 
 
 
403 aa  126  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3053  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  30.17 
 
 
827 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.050716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1970  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  28.48 
 
 
801 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.473081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  31.56 
 
 
837 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  29.18 
 
 
808 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0328  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.41 
 
 
407 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205835  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05591  nitrate reductase  29.68 
 
 
839 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1802  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 
405 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244015  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2293  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  28.48 
 
 
801 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.87 
 
 
506 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5894  nitrite reductase large subunit  31.94 
 
 
815 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4259  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
478 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0277148  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5009  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.75 
 
 
406 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323381  normal  0.355507 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1498  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.45 
 
 
393 aa  123  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0592  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  30.82 
 
 
820 aa  123  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0173  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 
422 aa  123  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4260  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  32.46 
 
 
837 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00961758  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3043  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  32.21 
 
 
811 aa  123  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301958  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.62 
 
 
412 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.048389  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  32.29 
 
 
810 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1990  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  28.4 
 
 
801 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.44 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.856464  hitchhiker  0.00707192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4493  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.12 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2309  NADH peroxidase  34.18 
 
 
554 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>