More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2834 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02561  nitric oxide reductase  97.35 
 
 
377 aa  750    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0978  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  97.35 
 
 
377 aa  748    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02526  hypothetical protein  97.35 
 
 
377 aa  750    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3027  nitric oxide reductase  86.13 
 
 
377 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3166  nitric oxide reductase  97.08 
 
 
377 aa  745    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2961  nitric oxide reductase  85.33 
 
 
377 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3183  nitric oxide reductase  81.17 
 
 
377 aa  634    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3961  nitric oxide reductase  97.61 
 
 
377 aa  749    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3043  nitric oxide reductase  86.13 
 
 
377 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0659662 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1001  nitric oxide reductase  97.35 
 
 
377 aa  748    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0544101  hitchhiker  0.00016497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2847  nitric oxide reductase  97.88 
 
 
377 aa  752    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2995  nitric oxide reductase  97.88 
 
 
377 aa  753    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2834  nitric oxide reductase  100 
 
 
377 aa  774    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3150  nitric oxide reductase  85.87 
 
 
377 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0327355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2992  nitric oxide reductase  86.13 
 
 
377 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3034  nitric oxide reductase  65.07 
 
 
379 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1020  nitric oxide reductase  58.76 
 
 
382 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.423073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0783  nitric oxide reductase  59.03 
 
 
382 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3261  nitric oxide reductase  55.56 
 
 
398 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4052  nitric oxide reductase  47.09 
 
 
381 aa  349  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3651  nitric oxide reductase  46.13 
 
 
389 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1582  nitric oxide reductase  45.24 
 
 
381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2200  nitric oxide reductase  44.3 
 
 
381 aa  334  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001302  nitric oxide reductase FlRd-NAD(+) reductase  45.09 
 
 
382 aa  332  9e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0681  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.13 
 
 
381 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3270  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.37 
 
 
382 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.415771  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  37.78 
 
 
461 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5028  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.92 
 
 
382 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2315  putative rubredoxin reductase  35.66 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70620  putative rubredoxin reductase  35.03 
 
 
384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6126  putative rubredoxin reductase  34.76 
 
 
384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  33.78 
 
 
477 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3591  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.8 
 
 
385 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1378  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.48 
 
 
389 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.529834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.77 
 
 
382 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.940486  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4857  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.93 
 
 
402 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.485222  normal  0.0812896 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.93 
 
 
455 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5314  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.39 
 
 
382 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0540022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.6 
 
 
382 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312913  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.86 
 
 
382 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3466  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
385 aa  202  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0171  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.88 
 
 
384 aa  202  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16415  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0789  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.46 
 
 
396 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5473  rubredoxin reductase  34.13 
 
 
382 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3669  putative rubredoxin reductase  35.47 
 
 
383 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0159  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
382 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5362  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.03 
 
 
382 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.303457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3250  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.2 
 
 
386 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0379  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.71 
 
 
383 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1816  rubredoxin-NAD(+) reductase  29.44 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.66 
 
 
480 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0092  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.88 
 
 
434 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.63 
 
 
444 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0338  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.67 
 
 
411 aa  170  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.63 
 
 
444 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.22 
 
 
469 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0307  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.8 
 
 
419 aa  163  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  30.93 
 
 
808 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.13 
 
 
476 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5894  nitrite reductase large subunit  33.13 
 
 
815 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.41 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.52 
 
 
444 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.67 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1667  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  30.33 
 
 
810 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0751233  normal  0.158912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2816  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.96 
 
 
413 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.477075  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  28.36 
 
 
816 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116537  normal  0.910407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1629  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  28.36 
 
 
816 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.899619  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0208  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.6 
 
 
801 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1997  nitrite reductase  29.64 
 
 
801 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00110354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2146  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  29.64 
 
 
801 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2177  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  29.64 
 
 
801 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.09 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1970  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  29.64 
 
 
801 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.473081  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4525  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  30.75 
 
 
820 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.927735  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2293  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  29.64 
 
 
801 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1949  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  29.97 
 
 
801 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0412209  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2061  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.98 
 
 
462 aa  139  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3162  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  27.86 
 
 
801 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00213461  normal  0.298002 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1990  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  28.05 
 
 
801 aa  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1990  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  28.43 
 
 
800 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2245  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.99 
 
 
837 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.240706 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0173  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.47 
 
 
358 aa  137  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2152  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  27.69 
 
 
801 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.57135  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2424  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  28.01 
 
 
801 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2472  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  28.01 
 
 
801 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3043  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  27.57 
 
 
811 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301958  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0200  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.09 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4243  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.48 
 
 
418 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2906  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  29.13 
 
 
1381 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1229  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.02 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.949165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  28.93 
 
 
870 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0740855  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_003296  RS03164  flavoprotein FAD oxidoreductase  28.88 
 
 
409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229065  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  27.75 
 
 
501 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.31 
 
 
475 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00187613  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7069  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.09 
 
 
421 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288328  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1755  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.61 
 
 
410 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430689  normal  0.0145499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0185  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  33.09 
 
 
421 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  28.57 
 
 
810 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1498  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.92 
 
 
393 aa  126  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.55 
 
 
399 aa  126  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000657276  hitchhiker  8.86215e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>