More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3261 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3261  nitric oxide reductase  100 
 
 
398 aa  807    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1020  nitric oxide reductase  60.82 
 
 
382 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.423073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0783  nitric oxide reductase  61.08 
 
 
382 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0978  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.56 
 
 
377 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2834  nitric oxide reductase  55.56 
 
 
377 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1001  nitric oxide reductase  55.56 
 
 
377 aa  418  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0544101  hitchhiker  0.00016497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2995  nitric oxide reductase  55.81 
 
 
377 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02561  nitric oxide reductase  55.3 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2847  nitric oxide reductase  55.56 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02526  hypothetical protein  55.3 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3961  nitric oxide reductase  55.56 
 
 
377 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3027  nitric oxide reductase  56.44 
 
 
377 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3043  nitric oxide reductase  56.19 
 
 
377 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0659662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3150  nitric oxide reductase  56.7 
 
 
377 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0327355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2992  nitric oxide reductase  56.44 
 
 
377 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3166  nitric oxide reductase  55.04 
 
 
377 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2961  nitric oxide reductase  56.44 
 
 
377 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3183  nitric oxide reductase  52.71 
 
 
377 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3034  nitric oxide reductase  52.99 
 
 
379 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4052  nitric oxide reductase  45.31 
 
 
381 aa  333  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001302  nitric oxide reductase FlRd-NAD(+) reductase  44.04 
 
 
382 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2200  nitric oxide reductase  41.15 
 
 
381 aa  309  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3651  nitric oxide reductase  42.68 
 
 
389 aa  299  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1582  nitric oxide reductase  41.65 
 
 
381 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3270  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.15 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.415771  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4857  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.6 
 
 
402 aa  210  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.485222  normal  0.0812896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3669  putative rubredoxin reductase  36.43 
 
 
383 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0171  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.76 
 
 
384 aa  202  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0681  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.85 
 
 
381 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.48 
 
 
455 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3466  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.6 
 
 
385 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3591  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.52 
 
 
385 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0159  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.5 
 
 
382 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1378  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.7 
 
 
389 aa  193  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.529834  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  33.5 
 
 
477 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70620  putative rubredoxin reductase  36.25 
 
 
384 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  37.53 
 
 
461 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6126  putative rubredoxin reductase  36.56 
 
 
384 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5314  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.9 
 
 
382 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0540022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.47 
 
 
382 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.25 
 
 
382 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312913  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5028  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.1 
 
 
382 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
382 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.940486  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5362  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.82 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.303457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2315  putative rubredoxin reductase  35.14 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0092  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.79 
 
 
434 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5473  rubredoxin reductase  33.9 
 
 
382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0789  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.43 
 
 
396 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.4 
 
 
480 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.2 
 
 
469 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0379  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.15 
 
 
383 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1816  rubredoxin-NAD(+) reductase  29.21 
 
 
383 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3250  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.81 
 
 
386 aa  166  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.41 
 
 
476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0338  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.78 
 
 
411 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2061  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.32 
 
 
462 aa  156  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0307  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.91 
 
 
399 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000657276  hitchhiker  8.86215e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5925  nitrite reductase  32.49 
 
 
467 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.623212  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.72 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0668  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  29.67 
 
 
826 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.99 
 
 
445 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0173  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.72 
 
 
358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.11 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  29.04 
 
 
884 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0208  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  30.79 
 
 
801 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1237  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.71 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.15 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.920633  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1700  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  31.68 
 
 
811 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.575793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2152  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  29.47 
 
 
801 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.57135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  27.27 
 
 
878 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3162  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  29.47 
 
 
801 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00213461  normal  0.298002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2129  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.87 
 
 
996 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0052941 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2424  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.83 
 
 
801 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2965  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  32.57 
 
 
817 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2906  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  31.43 
 
 
1381 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2472  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.83 
 
 
801 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  29.61 
 
 
808 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1990  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  27.83 
 
 
801 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1970  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  29.04 
 
 
801 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.473081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.64 
 
 
444 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.33 
 
 
444 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  26.95 
 
 
878 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2177  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  28.71 
 
 
801 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1997  nitrite reductase  28.71 
 
 
801 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00110354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2146  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  28.71 
 
 
801 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.48 
 
 
406 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2956  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  31.65 
 
 
818 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1949  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  28.71 
 
 
801 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0412209  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4849  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.62 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2293  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  28.81 
 
 
801 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2965  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.82 
 
 
418 aa  121  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.451629  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5894  nitrite reductase large subunit  28.81 
 
 
815 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4820  assimilatory nitrate reductase (NADH) small subunit  32.14 
 
 
413 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713443  normal  0.685908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41530  assimilatory nitrite reductase large subunit  31.8 
 
 
816 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1781  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  31.15 
 
 
823 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3230  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.82 
 
 
399 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180349  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3281  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.82 
 
 
399 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0482822  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3219  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.82 
 
 
399 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3043  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  29.57 
 
 
811 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301958  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>