More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3065 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3065  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 383 aa  758    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 		 384 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0286  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.96 
 
 		 385 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3419  alcohol dehydrogenase YqhD  39.01 
 
 		 387 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3348  alcohol dehydrogenase YqhD  39.01 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.838329  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3514  alcohol dehydrogenase YqhD  39.01 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.47 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.47 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.47 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3339  alcohol dehydrogenase YqhD  38.74 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3413  alcohol dehydrogenase YqhD  38.74 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  39.52 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3925  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.66 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 385 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 385 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  38.48 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3765  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  38.22 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  38.22 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  38.22 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  38.22 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  38.22 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  38.22 
 
 		 387 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.56 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.56 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.56 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.56 
 
 		 513 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.56 
 
 		 540 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.56 
 
 		 521 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3422  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0380  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0337  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0261  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 		 385 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883451  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4469  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.18 
 
 		 385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 387 aa  289  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0260  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.66 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464229 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3761  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2492  butanol dehydrogenase, NADH-dependent, putative  41.73 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3603  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3349  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.56 
 
 		 385 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0753084  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0050  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.14 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1645  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.66 
 
 		 383 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0757662  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0017  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3111  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.08 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1013  iron-containing alcohol dehydrogenase  34 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1352  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 		 410 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1096  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.149705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0073  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1700  putative oxidoreductase  37.15 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0070  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.32 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1715  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 386 aa  242  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1126  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 		 386 aa  242  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1035  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1094  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0640  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0760  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.473992  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1151  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.81 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05947  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000212  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3672  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.5 
 
 		 382 aa  202  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  32.35 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2158  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 		 385 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  29 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.07 
 
 		 391 aa  172  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.88 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  27.87 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.19 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.19 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.29 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  28.88 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.71 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  27.59 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  28.88 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 		 387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.4 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.71 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.2 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 395 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.61 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1285  NADH-dependent butanol dehydrogenase a  25.92 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.16188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.34 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>