More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2232 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2232  PhoH family protein  100 
 
 
356 aa  723    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  52 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000842405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  52.77 
 
 
319 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  50 
 
 
320 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  52.86 
 
 
320 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  49.36 
 
 
361 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  47.44 
 
 
328 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  46.69 
 
 
322 aa  292  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  50.64 
 
 
326 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  49.02 
 
 
352 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  51.69 
 
 
319 aa  288  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  50.16 
 
 
333 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1566  PhoH-like protein  48.23 
 
 
322 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.359583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  51.33 
 
 
339 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  50.16 
 
 
359 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  46.03 
 
 
320 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  51.01 
 
 
319 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  51.01 
 
 
319 aa  285  9e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  47.42 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  50.17 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  49.38 
 
 
361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  50.84 
 
 
319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  50.84 
 
 
319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  50.84 
 
 
319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  50.84 
 
 
319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  50.84 
 
 
319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  51.18 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  51.18 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  48.36 
 
 
320 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  50.68 
 
 
341 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  45.83 
 
 
333 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  48.37 
 
 
335 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1415  PhoH family protein  45.45 
 
 
332 aa  280  2e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  47.54 
 
 
325 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0593  PhoH-like protein  47.78 
 
 
333 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.318782  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  48.37 
 
 
335 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  50.67 
 
 
318 aa  279  6e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2538  PhoH-like protein  47.91 
 
 
317 aa  278  8e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00160717  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2048  PhoH family protein  49.84 
 
 
323 aa  278  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  49.16 
 
 
327 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  49.16 
 
 
340 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  46.2 
 
 
345 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  48.4 
 
 
316 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  48.66 
 
 
340 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  48.17 
 
 
323 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0329  PhoH family protein  47.27 
 
 
316 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1072  PhoH family protein  50.18 
 
 
315 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0267043  normal  0.22845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  49.06 
 
 
328 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4354  PhoH-like protein  48.65 
 
 
317 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000244605  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  44.98 
 
 
348 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  49.5 
 
 
328 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  48.98 
 
 
340 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  50.96 
 
 
328 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1917  PhoH family protein  45.14 
 
 
321 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  45.94 
 
 
319 aa  276  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1985  PhoH family protein  49.36 
 
 
323 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.460583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  45.85 
 
 
359 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  45.85 
 
 
359 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  47.08 
 
 
354 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  46.86 
 
 
351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  47.25 
 
 
316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  50.51 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  47.08 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  46.45 
 
 
323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  49.35 
 
 
319 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  50.17 
 
 
336 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  47.92 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  46.09 
 
 
359 aa  272  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5436  PhoH family protein  48.61 
 
 
319 aa  272  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  48.11 
 
 
350 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0986  PhoH family protein  47.68 
 
 
318 aa  272  8.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  48.41 
 
 
332 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1511  PhoH-like protein  50.17 
 
 
303 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  47.34 
 
 
349 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  48.41 
 
 
332 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  50.83 
 
 
325 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1653  phoH family protein  48.17 
 
 
332 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  46.77 
 
 
344 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  46.77 
 
 
364 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  49.66 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  46.45 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  48.55 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  47.39 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  46.56 
 
 
338 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  46.71 
 
 
316 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  47.37 
 
 
345 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  46.77 
 
 
349 aa  269  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  49.18 
 
 
332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0242  PhoH family protein  45.37 
 
 
344 aa  269  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1546  PhoH family protein  44.28 
 
 
350 aa  269  7e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  46.53 
 
 
323 aa  268  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  47.49 
 
 
315 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  47.49 
 
 
315 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1184  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  45.34 
 
 
319 aa  268  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  45.87 
 
 
337 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  46.54 
 
 
357 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  47.83 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  46.18 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  45.48 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1285  PhoH family protein  48.84 
 
 
322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>