More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1072 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1072  PhoH family protein  100 
 
 
315 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0267043  normal  0.22845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1917  PhoH family protein  74.69 
 
 
321 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2971  phosphate starvation-inducible protein  61.73 
 
 
328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.151752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1863  PhoH family protein  56.56 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1385  PhoH family protein  53.8 
 
 
320 aa  342  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5436  PhoH family protein  54.6 
 
 
319 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0564  hypothetical protein  54.31 
 
 
314 aa  339  4e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0762786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08381  putative phosphate starvation-inducible PhoH-like protein  53.5 
 
 
317 aa  338  7e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0790911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0754  PhoH family protein  53.46 
 
 
329 aa  333  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1209  PhoH family protein  52.83 
 
 
318 aa  330  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085366  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1093  PhoH family protein  51.57 
 
 
320 aa  328  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2725  PhoH family protein  51.88 
 
 
316 aa  325  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1415  PhoH family protein  53.46 
 
 
319 aa  325  9e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000470642  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0795  PhoH family protein  50.64 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1152  PhoH family protein  51.57 
 
 
321 aa  318  7e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1083  PhoH family protein  52.4 
 
 
319 aa  316  3e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0140162  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0975  PhoH family protein  49.04 
 
 
330 aa  312  5.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.650171 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1166  PhoH family protein  53.5 
 
 
319 aa  300  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000917895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  51.47 
 
 
333 aa  299  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  49.84 
 
 
319 aa  295  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  52.16 
 
 
322 aa  295  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  48.87 
 
 
320 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  49.84 
 
 
328 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2538  PhoH-like protein  49.68 
 
 
317 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00160717  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  49.36 
 
 
348 aa  288  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2206  PhoH family protein  45.25 
 
 
333 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3387  PhoH family protein  46.82 
 
 
375 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  53.74 
 
 
320 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  48.11 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000842405 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  50.49 
 
 
323 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2048  PhoH family protein  52.61 
 
 
323 aa  286  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  51.48 
 
 
329 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  47.73 
 
 
328 aa  285  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  48.68 
 
 
319 aa  285  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1156  PhoH family protein  51.11 
 
 
340 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  48.34 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  49.35 
 
 
320 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  50 
 
 
381 aa  285  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  48.68 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  48.68 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  48.68 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  48.68 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  48.34 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  49.01 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  48.68 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  49.67 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  48.34 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  46.6 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11730  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  47.25 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  48.34 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0789  PhoH family protein  50.5 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0567134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1969  PhoH family protein  49.51 
 
 
362 aa  281  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000703344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2188  PhoH family protein  45.81 
 
 
345 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1566  PhoH-like protein  49.36 
 
 
322 aa  278  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.359583  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2232  PhoH family protein  50.18 
 
 
356 aa  277  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211713  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12340  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  47.52 
 
 
357 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48706  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3159  PhoH family protein  48.84 
 
 
343 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00307849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  48.51 
 
 
361 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2232  PhoH family protein  48.68 
 
 
362 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00260346  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  61.68 
 
 
353 aa  277  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  47.1 
 
 
348 aa  276  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0593  PhoH-like protein  45.28 
 
 
333 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.318782  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  49.83 
 
 
352 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7049  PhoH family protein  47.25 
 
 
393 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  48.9 
 
 
325 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  47.77 
 
 
354 aa  275  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  47.85 
 
 
316 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1415  PhoH family protein  47.5 
 
 
332 aa  275  9e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  50.31 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1546  PhoH family protein  46.03 
 
 
350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  48.24 
 
 
354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  51.4 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  45.3 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  46.54 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  44.83 
 
 
361 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  48.34 
 
 
359 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  47.17 
 
 
351 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0707  PhoH family protein  47.12 
 
 
369 aa  272  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1267  PhoH-like protein  48.04 
 
 
345 aa  272  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  48.75 
 
 
331 aa  271  9e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17250  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  46.2 
 
 
350 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.465991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  46.86 
 
 
335 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1658  PhoH family protein  48.24 
 
 
376 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  48.04 
 
 
328 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  46.86 
 
 
335 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  50.89 
 
 
316 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1750  PhoH family protein  45.57 
 
 
376 aa  268  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224703  normal  0.417547 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  49.82 
 
 
341 aa  268  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13470  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  45.16 
 
 
353 aa  268  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1511  PhoH-like protein  48.51 
 
 
303 aa  268  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1285  PhoH family protein  48.58 
 
 
322 aa  267  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1145  PhoH family protein  45.81 
 
 
317 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  46.73 
 
 
337 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1912  PhoH family protein  46.77 
 
 
345 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  46.67 
 
 
327 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1401  PhoH family protein  48.58 
 
 
322 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.100499  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  42.68 
 
 
348 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  51.08 
 
 
323 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  42.68 
 
 
348 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2706  PhoH family protein  48.03 
 
 
353 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>