More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1152 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1152  PhoH family protein  100 
 
 
321 aa  651    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1083  PhoH family protein  81.13 
 
 
319 aa  530  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0140162  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1415  PhoH family protein  79.62 
 
 
319 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000470642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1385  PhoH family protein  73.12 
 
 
320 aa  491  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1166  PhoH family protein  79.94 
 
 
319 aa  481  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000917895  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1209  PhoH family protein  73.97 
 
 
318 aa  482  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085366  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1093  PhoH family protein  72.81 
 
 
320 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0754  PhoH family protein  55.84 
 
 
329 aa  343  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1072  PhoH family protein  51.57 
 
 
315 aa  318  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0267043  normal  0.22845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1917  PhoH family protein  50.63 
 
 
321 aa  318  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1863  PhoH family protein  48.44 
 
 
322 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5436  PhoH family protein  50.78 
 
 
319 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  50.65 
 
 
319 aa  299  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  49.84 
 
 
319 aa  298  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  49.67 
 
 
320 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  49.51 
 
 
319 aa  295  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  49.51 
 
 
319 aa  295  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  49.51 
 
 
319 aa  295  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  49.51 
 
 
319 aa  295  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  49.51 
 
 
319 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  49.51 
 
 
319 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  49.51 
 
 
319 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  49.51 
 
 
319 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  49.18 
 
 
319 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  49.5 
 
 
318 aa  293  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  49.84 
 
 
322 aa  292  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  47.48 
 
 
348 aa  292  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  50.81 
 
 
320 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  51.16 
 
 
328 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  49.23 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0593  PhoH-like protein  49.84 
 
 
333 aa  288  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.318782  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  47.63 
 
 
333 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  50.16 
 
 
323 aa  287  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  50.16 
 
 
359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1546  PhoH family protein  50 
 
 
350 aa  286  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  47.06 
 
 
320 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  50.16 
 
 
353 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2725  PhoH family protein  46.3 
 
 
316 aa  285  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308354  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0795  PhoH family protein  45.83 
 
 
316 aa  285  8e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  49.69 
 
 
345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7049  PhoH family protein  47.77 
 
 
393 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1285  PhoH family protein  48.7 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2971  phosphate starvation-inducible protein  46.39 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.151752 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1401  PhoH family protein  49.03 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.100499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  49.35 
 
 
329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1156  PhoH family protein  49.69 
 
 
340 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1985  PhoH family protein  49.35 
 
 
323 aa  281  8.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.460583  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1415  PhoH family protein  48.21 
 
 
332 aa  281  9e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0986  PhoH family protein  50.32 
 
 
318 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1566  PhoH-like protein  47.21 
 
 
322 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.359583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2206  PhoH family protein  49.5 
 
 
333 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548846 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  51.16 
 
 
315 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  51.16 
 
 
315 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0789  PhoH family protein  49.84 
 
 
333 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0567134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  48.99 
 
 
331 aa  279  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  48.68 
 
 
319 aa  279  5e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  51.13 
 
 
336 aa  278  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  50.51 
 
 
328 aa  278  9e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08381  putative phosphate starvation-inducible PhoH-like protein  45.57 
 
 
317 aa  278  9e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0790911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0777  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  47.39 
 
 
330 aa  277  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211004  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  46.69 
 
 
362 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  46.47 
 
 
341 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  49.19 
 
 
325 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  46.83 
 
 
325 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  49.19 
 
 
381 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  46.41 
 
 
357 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11730  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  47.96 
 
 
346 aa  275  5e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  49.02 
 
 
340 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  47.92 
 
 
340 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  50.17 
 
 
315 aa  275  9e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  48.68 
 
 
328 aa  275  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13470  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  49.49 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  49.67 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  49.67 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3387  PhoH family protein  48.4 
 
 
375 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  47.28 
 
 
352 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  47.59 
 
 
320 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1969  PhoH family protein  47.52 
 
 
362 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000703344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0242  PhoH family protein  45.07 
 
 
344 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  49.35 
 
 
332 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0329  PhoH family protein  45.45 
 
 
316 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1750  PhoH family protein  48.68 
 
 
376 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224703  normal  0.417547 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  44.89 
 
 
359 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  48.09 
 
 
328 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  49.68 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  49.68 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  45.54 
 
 
359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  47.74 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3832  PhoH family protein  50.33 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  48.03 
 
 
337 aa  269  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1267  PhoH-like protein  47.06 
 
 
345 aa  269  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3453  PhoH family protein  49.84 
 
 
380 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.127019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  50 
 
 
340 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  50 
 
 
340 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  48.84 
 
 
334 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  48.73 
 
 
354 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12340  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  45.79 
 
 
357 aa  267  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  45.28 
 
 
324 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000842405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  48.41 
 
 
348 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0707  PhoH family protein  48.5 
 
 
369 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>