More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0526 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0526  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 72 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11892  normal  0.0775298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0211  translation initiation factor IF-1  95.83 
 
 		 87 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.939577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1676  translation initiation factor IF-1  97.22 
 
 		 72 aa  143  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.446088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0640  translation initiation factor IF-1  95.83 
 
 		 72 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1130  translation initiation factor IF-1  97.22 
 
 		 72 aa  143  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0438739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0758  translation initiation factor IF-1  95.83 
 
 		 72 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3585  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 		 72 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.974289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0270  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 		 72 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0242  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 		 72 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00952866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0323  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 		 72 aa  141  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0267  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000603814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0249  translation initiation factor IF-1  93.06 
 
 		 72 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.410715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0187  translation initiation factor IF-1  91.67 
 
 		 72 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0982  translation initiation factor IF-1  91.67 
 
 		 72 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0211  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 		 72 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2872  translation initiation factor IF-1  90.28 
 
 		 72 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0587815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3557  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 		 72 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.177852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1790  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684782  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2139  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 		 72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4110  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 		 72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1916  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 		 72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2692  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0849354  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0599  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 		 72 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2278  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 		 72 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414764  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0626  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 		 72 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1058  translation initiation factor IF-1  81.69 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 78 aa  114  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 78 aa  114  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3205  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.737724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4661  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0692274  normal  0.0189166 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0788  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0700  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4193  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562224  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2954  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2034  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0662  translation initiation factor 1  62.5 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1670  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0312  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3704  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1183  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219123  normal  0.976132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0989  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0676628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1053  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7021  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.037971  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4823  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 83 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.407366  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1792  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 94 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 73 aa  103  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 73 aa  103  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3402  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0168888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3512  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.684385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0399  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 93 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 75 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5430  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2444  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.546311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 73 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1740  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2051  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.708179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 75 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2239  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0509  translation initiation factor 1  65.71 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5742  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3132  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319222  normal  0.203192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1932  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000750543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3906  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1688  translation initiation factor 1  68.57 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000115833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5176  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 73 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.411739  normal  0.733527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  63.89 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  61.11 
 
 		 87 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1463  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1552  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0981  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.359493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  67.14 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1356  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3352  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0756524  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5188  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 73 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5211  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2174  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 73 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.466444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  58.33 
 
 		 73 aa  99.4  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0539  translation initiation factor 1  64.29 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.3184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>