More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4661 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4661  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 82 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0692274  normal  0.0189166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2034  translation initiation factor IF-1  96.3 
 
 		 88 aa  163  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1670  translation initiation factor IF-1  96.3 
 
 		 88 aa  163  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4823  translation initiation factor IF-1  95.06 
 
 		 83 aa  160  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.407366  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2954  translation initiation factor IF-1  95.06 
 
 		 85 aa  159  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5211  translation initiation factor IF-1  87.34 
 
 		 90 aa  146  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1356  translation initiation factor IF-1  81.71 
 
 		 85 aa  144  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0981  translation initiation factor IF-1  81.71 
 
 		 85 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.359493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3132  translation initiation factor IF-1  82.93 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319222  normal  0.203192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3906  translation initiation factor IF-1  88.89 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0509  translation initiation factor 1  75.9 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1086  translation initiation factor IF-1  80.52 
 
 		 85 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.27871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0775  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 		 88 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0735491  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2388  translation initiation factor IF-1  82.67 
 
 		 86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2961  translation initiation factor IF-1  82.67 
 
 		 86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0227177  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0539  translation initiation factor 1  77.22 
 
 		 88 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.3184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0625  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.336813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0646  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0587  translation initiation factor IF-1  69.14 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1463  translation initiation factor IF-1  71.25 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0662  translation initiation factor 1  70.42 
 
 		 95 aa  116  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3442  translation initiation factor IF-1  69.14 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0386884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2174  translation initiation factor IF-1  74.65 
 
 		 73 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.466444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5742  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 		 73 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2051  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 		 72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.708179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2444  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 		 72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.546311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2239  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1067  translation initiation factor IF-1  67.5 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5666  translation initiation factor IF-1  67.5 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2156  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5188  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4167  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.48128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4408  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7021  translation initiation factor IF-1  61.25 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.037971  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3205  translation initiation factor IF-1  61.45 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.737724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5176  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 73 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.411739  normal  0.733527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5094  translation initiation factor IF-1  68.75 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4463  translation initiation factor IF-1  67.09 
 
 		 87 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5839  translation initiation factor IF-1  67.09 
 
 		 87 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1450  translation initiation factor IF-1  67.09 
 
 		 87 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3905  translation initiation factor IF-1  67.09 
 
 		 87 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5430  translation initiation factor IF-1  59.49 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1792  translation initiation factor IF-1  60.49 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1740  translation initiation factor IF-1  59.49 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3512  translation initiation factor IF-1  60.49 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.684385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1183  translation initiation factor IF-1  59.04 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219123  normal  0.976132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0989  translation initiation factor IF-1  59.04 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0676628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1053  translation initiation factor IF-1  59.04 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3402  translation initiation factor IF-1  59.49 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0168888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0399  translation initiation factor IF-1  61.54 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4193  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1057  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 73 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2202  translation initiation factor IF-1  69.33 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0312  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1295  translation initiation factor IF-1  69.33 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3704  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1139  translation initiation factor IF-1  69.33 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.755906  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5765  translation initiation factor IF-1  68.35 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806393 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1131  translation initiation factor IF-1  69.33 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125919  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4360  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3899  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1130  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0438739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3585  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.974289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1058  translation initiation factor IF-1  61.25 
 
 		 98 aa  106  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0982  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0526  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11892  normal  0.0775298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2872  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0587815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0640  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0249  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  104  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.410715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0211  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.939577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0323  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0267  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000603814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 77 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 77 aa  103  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2139  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  67.14 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0211  translation initiation factor IF-1  61.97 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  65.71 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1285  translation initiation factor IF-1  58.44 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2692  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0849354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>