More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4167 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4167  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
109 aa  219  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.48128  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5839  translation initiation factor IF-1  93.18 
 
 
87 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195419  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4463  translation initiation factor IF-1  93.18 
 
 
87 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3905  translation initiation factor IF-1  93.18 
 
 
87 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1450  translation initiation factor IF-1  92.05 
 
 
87 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4360  translation initiation factor IF-1  90.91 
 
 
87 aa  160  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3899  translation initiation factor IF-1  90.91 
 
 
87 aa  160  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1067  translation initiation factor IF-1  84.27 
 
 
90 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5666  translation initiation factor IF-1  84.27 
 
 
90 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3442  translation initiation factor IF-1  84.09 
 
 
87 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0386884  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5765  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5094  translation initiation factor IF-1  79.55 
 
 
88 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4408  translation initiation factor IF-1  79.55 
 
 
88 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1131  translation initiation factor IF-1  86.67 
 
 
88 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125919  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2202  translation initiation factor IF-1  86.67 
 
 
88 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1139  translation initiation factor IF-1  86.67 
 
 
88 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.755906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1295  translation initiation factor IF-1  86.67 
 
 
88 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0981  translation initiation factor IF-1  67.47 
 
 
85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.359493  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1463  translation initiation factor IF-1  65 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1356  translation initiation factor IF-1  67.06 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0509  translation initiation factor 1  65 
 
 
87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2174  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
73 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.466444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5742  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5211  translation initiation factor IF-1  63.74 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0587  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2156  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
73 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4661  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
82 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0692274  normal  0.0189166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0989  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 
91 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0676628  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1053  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 
91 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0840947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1183  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 
91 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219123  normal  0.976132 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5188  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3132  translation initiation factor IF-1  62.07 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319222  normal  0.203192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0539  translation initiation factor 1  69.01 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.3184  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2954  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119854  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2051  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.708179  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2239  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2034  translation initiation factor IF-1  65.38 
 
 
88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2444  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.546311  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1670  translation initiation factor IF-1  65.38 
 
 
88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3906  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3402  translation initiation factor IF-1  58.89 
 
 
91 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5176  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
73 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.411739  normal  0.733527 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4823  translation initiation factor IF-1  64.1 
 
 
83 aa  107  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.407366  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0399  translation initiation factor IF-1  57.47 
 
 
93 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2388  translation initiation factor IF-1  62.96 
 
 
86 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2961  translation initiation factor IF-1  62.96 
 
 
86 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0227177  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7021  translation initiation factor IF-1  56.67 
 
 
96 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.037971  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1086  translation initiation factor IF-1  60.98 
 
 
85 aa  105  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.27871  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0646  translation initiation factor IF-1  60.47 
 
 
89 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1792  translation initiation factor IF-1  56.82 
 
 
94 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0625  translation initiation factor IF-1  60.47 
 
 
89 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.336813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1740  translation initiation factor IF-1  56.47 
 
 
92 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5430  translation initiation factor IF-1  56.47 
 
 
92 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3512  translation initiation factor IF-1  54.84 
 
 
94 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.684385  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0775  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 
88 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0735491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4193  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 
92 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562224  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0312  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 
93 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0662  translation initiation factor 1  58.33 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3704  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 
93 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448152  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1057  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 
73 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1790  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 
72 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684782  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3205  translation initiation factor IF-1  58.02 
 
 
91 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.737724  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0982  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 
72 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2872  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 
72 aa  94.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0587815  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1762  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  56.94 
 
 
72 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3557  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 
72 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.177852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  58.57 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  58.57 
 
 
72 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2765  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 
72 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.219281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  58.57 
 
 
72 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  58.57 
 
 
72 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  58.57 
 
 
72 aa  90.5  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  58.57 
 
 
72 aa  90.5  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1285  translation initiation factor IF-1  55.42 
 
 
83 aa  90.5  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>