More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2139 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2139  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 72 aa  149  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2692  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 		 72 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0849354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0526  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 		 72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11892  normal  0.0775298 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0267  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000603814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0323  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1130  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0438739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0211  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 87 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.939577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3585  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.974289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0249  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.410715  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0211  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  124  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0640  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0270  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0242  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00952866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1676  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.446088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0758  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0187  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3557  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.177852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2872  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0587815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0982  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1916  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4110  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1058  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 		 98 aa  114  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61112  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 75 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 75 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2278  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414764  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0626  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0599  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 78 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1790  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684782  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 78 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  110  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  68.06 
 
 		 73 aa  110  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1790  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 74 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 74 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  70 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 74 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 74 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3205  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.737724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  66.67 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  70 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2698  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000441165  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1887  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000185401  hitchhiker  0.0000121311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1567  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216088  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000358057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000207147  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0421  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 74 aa  106  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4823  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.407366  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  105  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 75 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1407  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0166318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1675  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764362  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2531  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1734  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2691  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000360853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2604  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.62411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1603  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  63.89 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>