More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1552 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1552  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 72 aa  148  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  75 
 
 		 85 aa  116  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 73 aa  113  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 73 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 73 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  72.22 
 
 		 73 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  69.44 
 
 		 72 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 73 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  110  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  69.44 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 75 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 75 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 		 73 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  70.83 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  70.83 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 73 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 73 aa  107  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 73 aa  107  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  68.06 
 
 		 73 aa  107  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 74 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 83 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4936  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000594516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>