31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0580 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0580  putative nucleotide binding protein  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00170374 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1570  putative nucleotide binding protein  83.85 
 
 
193 aa  343  7e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1750  putative nucleotide binding protein  83.08 
 
 
195 aa  343  1e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000113303  hitchhiker  0.00274697 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0433  putative nucleotide binding protein  84.82 
 
 
194 aa  340  9e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1981  hypothetical protein  58.51 
 
 
191 aa  231  5e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.233146  normal  0.860493 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1103  hypothetical protein  38.67 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1585  hypothetical protein  37.57 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1090  hypothetical protein  37.57 
 
 
194 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.511138  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0763  Protein of unknown function DUF655  42.55 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0856  hypothetical protein  37.57 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0678355  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0055  hypothetical protein  35.68 
 
 
202 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000497721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1959  hypothetical protein  41.58 
 
 
187 aa  121  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.701597  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1382  hypothetical protein  35.16 
 
 
188 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0903  hypothetical protein  35.83 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000830366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3233  hypothetical protein  36.6 
 
 
240 aa  117  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0492905  normal  0.0819444 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1570  chaperonin Cpn60/TCP-1  40 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0264604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0995  hypothetical protein  40 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190993  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3028  hypothetical protein  41.58 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0549  Protein of unknown function DUF655  40.53 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.30809  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0353  putative nucleotide binding protein  39.07 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1806  Protein of unknown function DUF655  37.35 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1872  hypothetical protein  36.67 
 
 
187 aa  106  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.173998 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0063  hypothetical protein  36.46 
 
 
211 aa  106  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2390  Protein of unknown function DUF655  37.76 
 
 
202 aa  95.9  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1096  Protein of unknown function DUF655  36.42 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0622  Protein of unknown function DUF655  39.47 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.955174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2672  Protein of unknown function DUF655  32.97 
 
 
190 aa  92.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2103  Protein of unknown function DUF655  36.49 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0789741  normal  0.0844526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  55.56 
 
 
545 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  55.56 
 
 
545 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3270  DNA polymerase III subunit alpha  46.67 
 
 
1151 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>