28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1959 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1959  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  377  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.701597  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1872  hypothetical protein  65.24 
 
 
187 aa  263  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.173998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0549  Protein of unknown function DUF655  67.91 
 
 
186 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.30809  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3028  hypothetical protein  67.91 
 
 
186 aa  254  6e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1570  chaperonin Cpn60/TCP-1  54.84 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0264604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0903  hypothetical protein  48.62 
 
 
198 aa  184  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000830366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3233  hypothetical protein  50.54 
 
 
240 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0492905  normal  0.0819444 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0763  Protein of unknown function DUF655  49.73 
 
 
182 aa  178  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0995  hypothetical protein  48.35 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190993  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0055  hypothetical protein  44.09 
 
 
202 aa  157  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000497721  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0622  Protein of unknown function DUF655  45.25 
 
 
188 aa  153  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.955174  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1096  Protein of unknown function DUF655  41.57 
 
 
206 aa  144  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1103  hypothetical protein  40.78 
 
 
191 aa  143  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2390  Protein of unknown function DUF655  41.01 
 
 
202 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1090  hypothetical protein  41.34 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.511138  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1585  hypothetical protein  41.34 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2672  Protein of unknown function DUF655  38.89 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0856  hypothetical protein  41.48 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0678355  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2103  Protein of unknown function DUF655  40.91 
 
 
192 aa  139  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0789741  normal  0.0844526 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1981  hypothetical protein  42.55 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.233146  normal  0.860493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0580  putative nucleotide binding protein  41.58 
 
 
195 aa  121  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00170374 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1570  putative nucleotide binding protein  40 
 
 
193 aa  121  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1382  hypothetical protein  35.36 
 
 
188 aa  118  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0433  putative nucleotide binding protein  37.17 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1750  putative nucleotide binding protein  40.72 
 
 
195 aa  115  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000113303  hitchhiker  0.00274697 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0353  putative nucleotide binding protein  38.42 
 
 
209 aa  112  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1806  Protein of unknown function DUF655  37.02 
 
 
208 aa  106  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0063  hypothetical protein  38.67 
 
 
211 aa  104  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.098925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>