28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3233 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3233  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  495  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0492905  normal  0.0819444 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0903  hypothetical protein  66.31 
 
 
198 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000830366  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0995  hypothetical protein  54.89 
 
 
201 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190993  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0763  Protein of unknown function DUF655  51.1 
 
 
182 aa  189  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1959  hypothetical protein  50.54 
 
 
187 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.701597  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1872  hypothetical protein  47.28 
 
 
187 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.173998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0549  Protein of unknown function DUF655  47.51 
 
 
186 aa  165  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.30809  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3028  hypothetical protein  47.28 
 
 
186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0055  hypothetical protein  46.93 
 
 
202 aa  158  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000497721  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1090  hypothetical protein  40.53 
 
 
194 aa  151  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.511138  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1103  hypothetical protein  39.57 
 
 
191 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1585  hypothetical protein  41.57 
 
 
194 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0856  hypothetical protein  41.57 
 
 
194 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0678355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2672  Protein of unknown function DUF655  45.4 
 
 
190 aa  146  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1570  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.78 
 
 
192 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0264604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2390  Protein of unknown function DUF655  43.75 
 
 
202 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1096  Protein of unknown function DUF655  42.29 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0622  Protein of unknown function DUF655  42.2 
 
 
188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.955174  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0433  putative nucleotide binding protein  37.24 
 
 
194 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2103  Protein of unknown function DUF655  37.71 
 
 
192 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0789741  normal  0.0844526 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1750  putative nucleotide binding protein  38.14 
 
 
195 aa  119  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000113303  hitchhiker  0.00274697 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0580  putative nucleotide binding protein  36.6 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00170374 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0063  hypothetical protein  40.54 
 
 
211 aa  116  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1382  hypothetical protein  31.67 
 
 
188 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1981  hypothetical protein  35.45 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.233146  normal  0.860493 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1806  Protein of unknown function DUF655  39.89 
 
 
208 aa  115  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0353  putative nucleotide binding protein  37.5 
 
 
209 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1570  putative nucleotide binding protein  34.01 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>