28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1750 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1750  putative nucleotide binding protein  100 
 
 
195 aa  388  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000113303  hitchhiker  0.00274697 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0580  putative nucleotide binding protein  83.08 
 
 
195 aa  343  1e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00170374 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0433  putative nucleotide binding protein  84.29 
 
 
194 aa  337  8e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1570  putative nucleotide binding protein  82.81 
 
 
193 aa  333  1e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1981  hypothetical protein  55.85 
 
 
191 aa  225  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.233146  normal  0.860493 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1103  hypothetical protein  35.68 
 
 
191 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0055  hypothetical protein  37.3 
 
 
202 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000497721  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3233  hypothetical protein  38.14 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0492905  normal  0.0819444 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0903  hypothetical protein  37.43 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000830366  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1585  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1090  hypothetical protein  33.15 
 
 
194 aa  117  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.511138  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1382  hypothetical protein  37.16 
 
 
188 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0856  hypothetical protein  33.15 
 
 
194 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0678355  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0763  Protein of unknown function DUF655  42.05 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1959  hypothetical protein  40.72 
 
 
187 aa  115  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.701597  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1570  chaperonin Cpn60/TCP-1  40 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0264604 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3028  hypothetical protein  40.53 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1806  Protein of unknown function DUF655  37.95 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0549  Protein of unknown function DUF655  46.05 
 
 
186 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.30809  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0063  hypothetical protein  36.51 
 
 
211 aa  109  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0995  hypothetical protein  37.44 
 
 
201 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1872  hypothetical protein  38.67 
 
 
187 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.173998 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0353  putative nucleotide binding protein  37.75 
 
 
209 aa  105  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1096  Protein of unknown function DUF655  39.19 
 
 
206 aa  97.8  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2390  Protein of unknown function DUF655  39.44 
 
 
202 aa  94  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0622  Protein of unknown function DUF655  38.16 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.955174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2672  Protein of unknown function DUF655  36.49 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2103  Protein of unknown function DUF655  37.84 
 
 
192 aa  89  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0789741  normal  0.0844526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>