85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3889 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3889  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  100 
 
 		 366 aa  756    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.040112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3403  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  86.72 
 
 		 357 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2017  hypothetical protein  87.01 
 
 		 357 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1632  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  78.87 
 
 		 355 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.281691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1655  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  78.41 
 
 		 354 aa  587  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0111159  normal  0.447876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2113  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  78.69 
 
 		 354 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3626  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  78.41 
 
 		 354 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1904  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  78.16 
 
 		 351 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000223695  normal  0.490603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20050  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  74.21 
 
 		 353 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44280  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  73.22 
 
 		 352 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3767  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  72.65 
 
 		 352 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3375  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.73 
 
 		 366 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01186  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.18 
 
 		 363 aa  332  6e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0929  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.45 
 
 		 366 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.088881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3252  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.44 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.225665  normal  0.903193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3541  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.23 
 
 		 368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004249  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase mtfA  47.62 
 
 		 363 aa  329  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000917276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2891  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.01 
 
 		 361 aa  328  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117947  hitchhiker  0.00000824021 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0693  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.46 
 
 		 363 aa  328  9e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.716543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1353  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.73 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1367  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.73 
 
 		 361 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0458606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1392  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.73 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2792  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.73 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000590307  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2721  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.73 
 
 		 361 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  normal  0.0553209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2993  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.73 
 
 		 361 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0309366  hitchhiker  0.00000241621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3176  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.17 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2992  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.45 
 
 		 366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3064  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.45 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1285  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.73 
 
 		 361 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000107001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1536  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.01 
 
 		 361 aa  326  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0882  conserved hypothetical protein  48.17 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2950  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.17 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000823622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3112  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.17 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000130243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0906  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.17 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2947  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.17 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4070  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.17 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000374356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02618  hypothetical protein  48.17 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02657  predicted methyltransferase  48.17 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1001  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.74 
 
 		 368 aa  326  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000913251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1054  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.74 
 
 		 368 aa  326  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3219  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.74 
 
 		 368 aa  325  5e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000791022  normal  0.0810678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3803  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.73 
 
 		 367 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0270508  hitchhiker  0.000000465668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3205  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.32 
 
 		 366 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3142  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.32 
 
 		 366 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0783039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3125  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.32 
 
 		 366 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000738334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3468  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.59 
 
 		 358 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0401954  hitchhiker  0.000523336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3305  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.04 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.571863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3190  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.04 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.580308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3319  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.88 
 
 		 360 aa  318  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.045342  normal  0.821385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2981  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.31 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2761  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.88 
 
 		 363 aa  316  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0290768  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1613  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  43.47 
 
 		 365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.09552  normal  0.605694 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2562  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.18 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2426  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.73 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2780  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  45.3 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1153  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.33 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.203097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2412  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.13 
 
 		 357 aa  302  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0496  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  42.9 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0203038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2200  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  44.1 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1930  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  42.9 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.857797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1151  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  44.38 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  hitchhiker  0.0000000680038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0092  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  45.4 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1781  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  41.76 
 
 		 358 aa  276  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1647  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  43.6 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.092844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04620  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  43.8 
 
 		 347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0678  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  44.22 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.829891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2090  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  41.55 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2011  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  41.19 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.989087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02563  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  38.2 
 
 		 365 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00506422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1490  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  41.81 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.624039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1661  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  39.72 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1789  hypothetical protein  30.84 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4304  THUMP domain-containing protein  30.51 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50496  predicted protein  29.83 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2541  hypothetical protein  30 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00453654  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0643  hypothetical protein  29.5 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3257  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase MtfA  30 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2347  hypothetical protein  29.65 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0659  hypothetical protein  26.09 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0307  hypothetical protein  33.06 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0304  hypothetical protein  32.26 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.222321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49783  predicted protein  32.85 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.27 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1968  cell division protein FtsJ  33.03 
 
 		 199 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0248017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42900  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J/FtsJ  38.83 
 
 		 207 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>