26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2911 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  95.93 
 
 
123 aa  240  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  63.25 
 
 
122 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  58.97 
 
 
122 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  63.25 
 
 
124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  61.54 
 
 
119 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  58.4 
 
 
123 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  60.68 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  53.39 
 
 
119 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  57.27 
 
 
119 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  51.22 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  50.82 
 
 
122 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  52 
 
 
126 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  49.18 
 
 
119 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  51.22 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  49.58 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  50.43 
 
 
121 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  47.5 
 
 
119 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  47.15 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  45.76 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  37.3 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0734  hypothetical protein  36.07 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26257  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  29.87 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3667  hypothetical protein  34.04 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000951062  decreased coverage  0.00000000000750539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>