21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4773 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  156  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4043  hypothetical protein  59.15 
 
 		 77 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.131676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5362  hypothetical protein  48.28 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3661  hypothetical protein  48.48 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000704866  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0341  hypothetical protein  43.24 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4916  hypothetical protein  48.28 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000285344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  35.48 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  35.48 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  32.97 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0087  hypothetical protein  38.81 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723367  hitchhiker  0.00000000000806538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3667  hypothetical protein  34.78 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000951062  decreased coverage  0.00000000000750539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5247  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5302  hypothetical protein  30.85 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.50237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2468  hypothetical protein  36.23 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3468  hypothetical protein  38.81 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773986  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4069  hypothetical protein  36.23 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000330915  unclonable  0.000000659796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  29.87 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1771  hypothetical protein  33.8 
 
 		 99 aa  42  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372178  decreased coverage  0.000314834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.512803  normal  0.194465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>