14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3667 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3667  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000951062  decreased coverage  0.00000000000750539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1771  hypothetical protein  93.75 
 
 		 99 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372178  decreased coverage  0.000314834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4069  hypothetical protein  91.67 
 
 		 99 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000330915  unclonable  0.000000659796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1807  hypothetical protein  91.67 
 
 		 103 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.512803  normal  0.194465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3661  hypothetical protein  43.53 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000704866  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5362  hypothetical protein  38.04 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4916  hypothetical protein  36.47 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000285344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4043  hypothetical protein  31.51 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.131676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  34.78 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0341  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  35.11 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  34.04 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>