23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3815 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  245  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  93.28 
 
 
120 aa  227  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  93.28 
 
 
120 aa  227  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  77.69 
 
 
122 aa  184  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  74.4 
 
 
126 aa  177  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  74.79 
 
 
119 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  70.09 
 
 
119 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  64.29 
 
 
119 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  57.6 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  56.8 
 
 
127 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  54.4 
 
 
123 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  53.39 
 
 
124 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  51.67 
 
 
119 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  50.41 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  49.18 
 
 
123 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  52.54 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  49.15 
 
 
122 aa  105  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  46.72 
 
 
119 aa  94  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  45.08 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  41.88 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  38.89 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  42.98 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>