26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0817 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  238  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  94.92 
 
 
119 aa  228  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  49.17 
 
 
122 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  52.59 
 
 
119 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  47.5 
 
 
123 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  47.5 
 
 
123 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  48.33 
 
 
124 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  48.33 
 
 
122 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  47.97 
 
 
126 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  45.9 
 
 
119 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  47.11 
 
 
123 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  47.5 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  47.15 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  47.5 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  46.72 
 
 
119 aa  94  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  45.6 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  44.8 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  46.67 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  47.9 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  39.83 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  38.3 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0734  hypothetical protein  33.05 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26257  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  30.53 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3661  hypothetical protein  34.52 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000704866  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3667  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000951062  decreased coverage  0.00000000000750539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>