23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0727 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  260  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  74.8 
 
 		 127 aa  202  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  59.82 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  57.72 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  57.72 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  56.8 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  56.1 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  56.1 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  53.6 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  52.03 
 
 		 122 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  50.41 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  51.22 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  47.97 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  48 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  46.34 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  45.53 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  44.72 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  44.72 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  44.8 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  45.6 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  38.52 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  35.92 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  29.6 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>