25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5562 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  49.59 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  47.93 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  47.11 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  45.76 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  46.61 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  44.26 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  45.83 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  42.28 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  42.28 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  42.98 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  45.38 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  40.16 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  39.32 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  41.67 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  39.02 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  38.94 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  37.61 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  38.66 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  37.4 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  36.51 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  32.48 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3661  hypothetical protein  31.53 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000704866  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0734  hypothetical protein  25.64 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26257  normal  0.126132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>