23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3182 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  246  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  99.16 
 
 		 120 aa  244  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  93.28 
 
 		 119 aa  227  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  76.23 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  75.4 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  72.88 
 
 		 119 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  74.79 
 
 		 119 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  63.3 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  58.54 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  57.72 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  52.07 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  51.24 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  52.8 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  52.94 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  48.36 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  50.83 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  48.74 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  47.15 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  42.74 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  45.83 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  42.28 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  38.1 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>