23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5257 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  244  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  75.21 
 
 
122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  73.6 
 
 
126 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  74.79 
 
 
119 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  74.79 
 
 
120 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  74.79 
 
 
120 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  71.79 
 
 
119 aa  173  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  57.63 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  58.4 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  55.08 
 
 
124 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  52.14 
 
 
119 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  53.6 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  50.83 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  51.22 
 
 
123 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  49.58 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  49.58 
 
 
123 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  45.53 
 
 
122 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  45.9 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  45.9 
 
 
119 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  43.09 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  41.03 
 
 
121 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  38.1 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>