24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3185 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  260  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  80.65 
 
 
124 aa  204  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  83.05 
 
 
119 aa  204  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  60.68 
 
 
123 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  60.68 
 
 
123 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  55.17 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  51.72 
 
 
122 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  54.1 
 
 
122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  50.41 
 
 
119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  50.83 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  50.83 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  50.39 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  50.83 
 
 
120 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  51.38 
 
 
119 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  44.72 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  43.9 
 
 
127 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  44.44 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  47.9 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  47.06 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  44.26 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  39.68 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0734  hypothetical protein  41.1 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26257  normal  0.126132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>