24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1553 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  253  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  97.46 
 
 		 119 aa  237  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  80.65 
 
 		 128 aa  204  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  63.25 
 
 		 123 aa  147  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  63.25 
 
 		 123 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  58.12 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  52.14 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  55.08 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  53.28 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  52.8 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  50.85 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  51.16 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  53.39 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  52.07 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  52.07 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  54.13 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  48.78 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  45.53 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  48.33 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  47.5 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  44.44 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  40.16 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0734  hypothetical protein  38.46 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26257  normal  0.126132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>