25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4660 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  239  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  94.92 
 
 
119 aa  228  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  52.59 
 
 
119 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  50.83 
 
 
122 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  47.15 
 
 
123 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  47.15 
 
 
123 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  45.9 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  48.33 
 
 
122 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  47.5 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  55.43 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  50.52 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  44.8 
 
 
127 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  46.67 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  43.2 
 
 
127 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  45.83 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  45.83 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  45.08 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  44.72 
 
 
120 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  47.06 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  39.83 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  40.62 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0734  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26257  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  31.58 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3667  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000951062  decreased coverage  0.00000000000750539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>