26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3661 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3661  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  230  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000704866  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4043  hypothetical protein  54.93 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.131676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3667  hypothetical protein  43.53 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000951062  decreased coverage  0.00000000000750539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4069  hypothetical protein  41.51 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000330915  unclonable  0.000000659796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  48.48 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1771  hypothetical protein  46.34 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372178  decreased coverage  0.000314834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1807  hypothetical protein  43.9 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.512803  normal  0.194465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4916  hypothetical protein  45.88 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000285344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0341  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5362  hypothetical protein  43.53 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  33.02 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  32.08 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0087  hypothetical protein  38.1 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723367  hitchhiker  0.00000000000806538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  32.38 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2468  hypothetical protein  42.42 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3468  hypothetical protein  43.55 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773986  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  34.52 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  32.14 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2300  hypothetical protein  42.42 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.750268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  29.82 
 
 		 119 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  31.43 
 
 		 127 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.50237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5247  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>