25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0928 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  204  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  58.65 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  47.52 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  49.04 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  38.46 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  47.76 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  38.64 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  40.66 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  32.58 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  43.62 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4716  hypothetical protein  42.55 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  36.79 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  45.45 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1369  hypothetical protein  45.45 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600356  normal  0.166783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  39.13 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0271  hypothetical protein  40.22 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2053  hypothetical protein  39.47 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3523  hypothetical protein  32.18 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.490559  normal  0.659494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1107  hypothetical protein  33.71 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4486  putative iron uptake protein  40.58 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  28.41 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1238  hypothetical protein  32.91 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0278337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4118  putative iron uptake protein  40.58 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.74371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>