20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1238 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1238  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  228  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0278337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  45.83 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3309  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  41.67 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  41.67 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  41.67 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0108  hypothetical protein  41.24 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4292  hypothetical protein  39.56 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3078  hypothetical protein  45.35 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.963714  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1312  hypothetical protein  45.35 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234542  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1279  hypothetical protein  45.35 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1235  hypothetical protein  45.35 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3408  hypothetical protein  39.58 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2729  hypothetical protein  43.9 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4432  hypothetical protein  40.21 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  34.12 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2357  hypothetical protein  34.94 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.532778  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3411  hypothetical protein  36.14 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.031686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  27.66 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>