19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3309 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3309  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  224  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  71.56 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  60.2 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  46.73 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  46.73 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  47.17 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2357  hypothetical protein  47.83 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.532778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3078  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.963714  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1312  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234542  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1279  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1235  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3408  hypothetical protein  48.89 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4292  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1238  hypothetical protein  47.5 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0278337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0108  hypothetical protein  35.96 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2729  hypothetical protein  50.68 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4432  hypothetical protein  34.34 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  35.63 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  27.71 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>