24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3408 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3408  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  89.66 
 
 		 116 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  89.66 
 
 		 116 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  88.79 
 
 		 116 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1279  hypothetical protein  87.25 
 
 		 116 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3078  hypothetical protein  87.25 
 
 		 116 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.963714  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1312  hypothetical protein  87.25 
 
 		 116 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234542  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1235  hypothetical protein  87.25 
 
 		 116 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2729  hypothetical protein  83.62 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  49.51 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3309  hypothetical protein  48.89 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2357  hypothetical protein  46.34 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.532778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1238  hypothetical protein  41.25 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0278337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4236  hypothetical protein  37.27 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4370  hypothetical protein  35.45 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  38.89 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  31.82 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4164  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  28.4 
 
 		 108 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4432  hypothetical protein  29.63 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0108  hypothetical protein  29.89 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4292  hypothetical protein  29.63 
 
 		 108 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  31.37 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>