20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36960 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  207  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  58.51 
 
 		 110 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  63.22 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  40.23 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  36.9 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  31.87 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  39.36 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  37.89 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  35.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  31 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  36.84 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  38.1 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3309  hypothetical protein  28.42 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0264  hypothetical protein  27.37 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  30.68 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  38.1 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  30.68 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  30.68 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  34.44 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2729  hypothetical protein  31.82 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>